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科学家解译出真盐生植物异子蓬全基因组

放大字体  缩小字体 时间:2019-09-21 09:37:02  阅读:4545+ 作者:责任编辑NO。许安怡0216

异子蓬(Suaeda aralocaspica)是一年生真盐生植物,首要散布于中亚,在我国仅产于新疆。异子蓬在耐盐特性、光合作用和种子性状等方面具有重要的研讨价值。异子蓬可以在表层土壤含盐量超越10%的环境中正常成长,种子萌生耐盐性超越1000mmol/L NaCl。异子蓬的叶片、花被片和果实都能在单个细胞内完结C4光合作用,这与典型的具有花环结构(Kranz)的C4植物不同。别的,异子蓬能在同一果序的不同方位发生棕色和黑色两种类型的种子。

2019年9月,我国科学院新疆生态与地舆研讨所研讨员田长彦团队完结了异子蓬全基因组的测序、拼装,成功制作了异子蓬的全基因组草图。这是现在世界上首个测序的真盐生植物和单细胞C4植物。拼装完结的异子蓬基因组巨细约452Mb,占预估异子蓬基因组巨细的96.8%。共拼装得到4033个scaffolds,scaffold N50为1.83Mb。结合MAKER注释、同源蛋白序列注释以及来自不同安排的转录组数据,该研讨共注释得到29604个蛋白编码基因,1651个长非编码RNA,21个 microRNA。基因组重复序列份额为38.41%,其间48.5%为LTR逆转录转座子。依据BUSCO剖析,基因组完好性为89.5%。此外,该研讨还构建了全长146654 bp的完好叶绿体基因组。

该研讨取得新疆自治区要点研制方案项目、国家自然科学基金和国家要点研制方案的赞助。以上研讨成果以A draft genome assembly of halophyte Suaeda aralocaspica, a plant that performs C4 photosynthesis within individual cells为题发表于GigaScience。

来历:我国科学院新疆生态与地舆研讨所

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